L'OFD1 est associé à une létalité masculine prénatale dans presque tous les cas. Chez les patientes, un très haut degré de variabilité phénotypique est observé, allant de multiples malformations sévères et atteintes viscérales à uniquement des kystes rénaux ou des caractéristiques dysmorphiques. Les manifestations incluent des malformations orales dans plus de 95% des cas (langue lobée, hamartomes ou lipomes de la langue, ankyloglossie, fente palatine ou palais ogival, frein gingival accessoire, hypodontie (voir ce terme) ou dents surnuméraires, dysplasie de l'émail et malocclusion), des anomalies craniofaciales dans environ 87% des cas, incluant une dysmorphie faciale (hypertélorisme ou télécanthus, hypoplasie des ailes du nez, pseudofissure de la lèvre supérieure ou fente médiane, micrognathie, fentes palpébrales obliques en bas et en dehors), une alopécie/des cheveux anormaux, une miliaire faciale évanescente, des malformations digitales dans environ 88% des cas (brachydactylie, syndactylie, clinodactylie du cinquième doigt, hallux dupliqué/pouce élargi, polydactylie préaxiale ou postaxiale), une atteinte du SNC dans environ 50% des cas, incluant des anomalies cérébrales (kystes intracérébraux, agénésie du corps calleux, agénésie cérébelleuse avec ou sans malformation de Dandy-Walker) et une déficience intellectuelle légère à modérée. L'atteinte viscérale inclut une maladie rénale polykystique (au moins 50% des cas), et une maladie kystique hépatique et pancréatique. Des troubles de l'audition ont aussi été décrits dans environ 6% des cas.
L'OFD1 est causée par des mutations du gène OFD1 (Xp22) codant pour une protéine localisée dans le centrosome et le corps basal des cils primaires, jouant un rôle important dans le développement. Une fraction des cas montre des délétions génomiques. Une haute pénétrance a été rapportée mais l'expression est très variable.
