L'holoprosencéphalie (HPE) est une malformation cérébrale complexe due à un défaut de clivage médian du prosencéphale, survenant entre le 18e et le 28e jour de gestation, touchant le cerveau antérieur et le visage, à l'origine de manifestations neurologiques et d'anomalies faciales de degré variable.
L'étiologie de l'HPE est hétérogène : anomalies chromosomiques (telles que la trisomie 13), syndrome polymalformatif (tel que le syndrome de Smith-Lemli-Opitz et le syndrome de Charge) et facteurs environnementaux (diabète ou hypocholestérolémie maternels durant la grossesse). Dans l'HPE non chromosomique et non syndromique, 14 gènes au moins ont été impliqués: 4 gènes majeurs: SHH (pour "Sonic HedgeHog" , 7q36), ZIC2 (13q32), SIX3 (2p21), TGIF (18p11) et 10 gènes mineurs (PTCH1 (9q22), GLI2 (2q14), FOXH1 (8q24), TDGF1 (3p21), DISP1 (1q42), NODAL (10q22), FGF8 (10q24), GAS1 (9q21), DLL1 (6q27), et CDON (11q23-q24)).
